菊糖和菊糖低聚糖具有重要的健康、药用开发价值，可作为功能性食品或添加剂，具有抗肿瘤和刺激双歧杆菌生长的作用，也可作为膳食纤维用于防止糖尿病和减肥，还可用于改善肠胃功能，降低血脂和预防高胆固醇病等。菊粉内切酶在菊粉内部以随机方式切开菊粉链，生成聚合度不等的低聚果糖，不同微生物所产菊粉内切酶作用于菊粉的产物也各不相同。河南科技学院和中国农业科学院利用毕赤嗜甲醇酵母表达的重组黑曲霉菊粉内切酶，从菊苣粉中制取低聚果糖。
该研究用薄层色谱、离子色谱分析酶解产物，研究酶解条件，分析产物组成。研究表明菊粉浓度为20～160g/L、酶浓度为12U/g菊粉时，低聚果糖的最大产率逐渐升高然后下降在接近最大溶解度200g/L时，菊粉寡糖最大产率为62.0%，最大产量与酶的用量无关，但提高酶的浓度可以缩短达到最大产率的时间。pH5.5、50℃、菊粉浓度为40g/L、酶用量为12U/g菊粉时，可达到最大产率64.6%；酶解的产物主要为GF2到GF10的菊粉寡糖。
实际生产时，可直接把菊粉提取液调整到一定浓度，然后加入菊粉酶，在适宜的条件下酶解。酶解产物的组成与酶作用时间的关系不大，产物组成恒定，便于生产控制。该试验为提高功能性低聚糖菊糖和菊糖低菊糖产率提供了理想的工艺。