（一）按两相所处的状态分类
　　液体作为流动相，称为“液相色谱”（liquid chromatograp-hy）；用气体作为流动相，称为“气相色谱”（gas chromatogr-aphy）。固定相也有两种状态，以固体吸附剂作为固定相和以附载在固体上的液体作为固定相，所以层析法按两相所处的状态可以分为： 液－固色谱（liquid-solid chromatography）
液－液色谱（liquid-liquid chromatography）
气－固色谱（gas-solid chromatography）
气－液色谱（gas-liquid chromatography）（二）按层析过程的机理分类 　　吸附层析（adsorption chromatography ）利用吸附剂表面对不同组分吸附性能的差异，达到分离鉴定的目的。分配层析（partition chromatography）利用不同组分在流动相和固定相之间的分配系数（或溶解度）不同，而使之分离的方法。
　　离子交换层析（ion-exchange chromatography ）利用不同组分对离子交换剂亲和力的不同，而进行分离的方法。凝胶层析（gelchromatography）利用某些凝胶对于不同组分因分子大小不同而阻滞作用不同的差异，进行分离的技术。
（三）按操作形式不同分类 　　柱层析（colum chromatography）将固定相装于柱内，使样品沿一个方向移动而达到分离。纸层析（paper chrmatography）用滤纸作液体的载体（担体support），点样后，用流动相展开，以达到分离鉴定的目的。薄层层析（thin layper chromatography）将适当粒度的吸附剂铺成薄层，以纸层析类似的方法进行物质的分离和鉴定。